2020年6月16日，重庆市生态环境局表示，沿江24个区县全面完成入河排污口排查，转入“监测、溯源、整治”阶段。排查整治试点工作启动以来，先试先行的渝北区、两江新区共核实发现长江入河排污口356个。截至目前，重庆市长江、嘉陵江、乌江三江沿线24个区县入河排污口排查阶段工作已全面完成，全市核实疑似排污口4476个。
据悉，2019年2月15日，重庆启动长江入河排污口排查整治试点工作；6月，完成对三江区域的无人机一级航测工作；9月搭建工作专班，分6个组进驻沿江区县，合力完成二级人工排查工作；11月全面完成排查、监测、溯源阶段工作；计划在2020年11月底前全面完成试点工作。
长江入河排污口排查整治，2019年1月生态环境部宣布全面启动。专项行动的工作任务，可以概括为“查、测、溯、治”四项重点任务。即，摸清入海、入河排污口底数；开展入海、入河排污口监测；进行入海、入河排污口污水溯源；整治入海、入河排污口问题。
2月15日，生态环境部在重庆市组织召开了“长江入河排污口排查整治专项行动暨试点工作启动会”，之后专项行动选取江苏省泰州市和重庆市渝北区、两江新区开展试点工作。
9月，生态环境部组织1093名业务骨干，开展长江入河排污口现场排查(第一批)工作。涉及江苏、浙江、重庆、贵州、云南等5省份“1+16”城市约7000公里岸线，占长江全流域排查任务的30%。
期间，明察暗访不断，“应查尽查、不放过一个排口”、“关注三下五处二”、“将排污口逐个登记入册”，穿山越岭爬高坡，“攀登山崖排污口”、“深入沟底排污口”、“循迹江河排污口”、“深扒灌木杂草排污口”......深刻诠释了什么叫“一竿子插到底”。
2020年1月，生态环境部官微表示，横跨11省(市)63个城市，覆盖长江干流、9条主要支流及太湖，2.4万公里的长江入河排污口排查工作即将结束。
“现场排查工作只是排污口排查整治专项行动的开端。2020年，我们将在监测、溯源和整治上下功夫，按照‘一口一策’的原则，实行排污口的规范管理和整治销号制度，坚决打好长江保护修复和渤海综合治理攻坚战。”生态环境部生态环境执法局局长如是说。
